Le Honduras ne présente pas de très grand danger coté santé. Pour un voyage vers le Honduras, aucune vaccination n’est obligatoire. Toutefois, il est conseillé de faire les vaccins universels comme les vaccins contre la fièvre jaune, la fièvre typhoïde, les hépatites A et B mais aussi contre le tétanos, la diphtérie, la polio ou la coqueluche.

Il faut suivre un traitement contre le paludisme car le Honduras est une destination classée en zone 1. Méfiez-vous également des piqûres de moustiques qui, en plus du paludisme, ces piqûres peuvent entraîner a dengue.